姓名:吴璟莉

学位/职称:博士/教授

电子邮箱:wjlhappy@mailbox.gxnu.edu.cn               

研究领域:计算机算法与优化、生物信息学、智能优化算法

个人简介

吴璟莉,女,19781月出生。博士,教授,博士生导师,现任广西师范大学计算机科学与工程学院副院长,广西本科高校计算机类教学指导委员会委员广西高等教育学会计算机基础教育专委会副秘书长,广西人工智能学会理事2008年毕业于中南大学信息科学与工程学院,计算机应用专业,获工学博士学位。200912月晋升为副教授,201412月晋升为教授。目前主要从事计算机算法与优化、生物信息学、智能优化算法等方面的研究。先后主持国家自然科学基金项目2项、省部级项目3项,地厅级项目3项、校级项目5项;参与国家级、省部级项目8。在国内外权威期刊和国际知名会议上发表录用论文50余篇,其中SCI收录8篇,EI收录17篇,获国家发明专利1项。

学习和工作经历

19969月–20006广西大学,计算机与信息工程学院,计算机软件,工学学士

20009月–20036广西大学,计算机与信息工程学院,控制理论与控制工程,工学硕士

20037月–20058月,广西师范大学,数学与计算机科学学院,讲师

20059月–200812中南大学, 信息科学与工程学院,计算机应用,工学博士

2009年1月–2009年11月,广西师范大学,计算机科学与信息工程学院,讲师

200912月–201411广西师范大学,计算机科学与信息工程学院,副教

201412月–至今, 广西师范大学,计算机科学与工程学院,教授

研究兴趣

计算机算法与优化、生物信息学、智能优化算法

主要研究项目

  1.基于高通量多组学数据的癌症驱动通路识别算法研究,国家自然科学基金项目,编号:61762015,主持,2018-2021

 2.基于新一代测序技术的K单体型组装算法研究,国家自然科学基金项目,编号:61363035,主持,2014-2017

 3.基于新一代测序技术的病毒准种单体型组装算法研究,广西自然科学基金项目,编号:2015GXNSFAA139288,主持,2015-2018

 4.生物信息处理的组装算法研究,广西多源信息挖掘与安全重点实验室系统性研究基金项目(14-A-03-02),主持,2014-2016

 5.多倍体个体SNP 单体型检测的有效计算模型和算法研究,广西高等学校科学技术项目(2013YB028),主持,2013-2015  

 6.基于进化计算的三倍体个体单体型检测算法研究,广西自然科学基金项目(2011GXNSFB018068)主持,2011- 2014

 7.地方高校数据库系列课程的整合与优化,广西高等教育教学改革工程一般A类项目(2012JGA120),主持,2012-2014

 8.生物信息学中的相关组合理论和算法研究,国家自然科学基金重点项目(60433020),主要参与,2005-2008

主要科研论文

1Jingli Wu, Qi Zhang, Gaoshi Li. Identification of Cancer-Related Module in Protein-Protein Interaction Networks Based on Gene Prioritization.Journal of Bioinformatics and Computational Biology (Accepted)(SCI)

2Jingli Wu, Jifan Yang, Gaoshi Li, Jinyan Wang. IDM-SPS: Identifying driver module with somatic mutation, PPI network and subcellular localization,Engineering Applications of Artificial Intelligence. https://doi.org/10.1016/j.engappai.2021.104482  (中科院SCI二区)

3Jingli Wu, Kai Zhu, Gaoshi Li,YinyanWang, Qirong Cai. A Model and Algorithm for Identifying Driver Pathways Based on Weighted Non-binary Mutation Matrix, Applied Intelligence. 2021, DOI:10.1007/s10489-021-02330-5 (中科院SCI三区)

4Jingli Wu, Ke Pan, Gaoshi Li, Kai Zhu, Qirong Cai. Two Novel Models and a Parthenogenetic Algorithm for Detecting Common Driver Pathways from Pan-Cancer Data, Engineering Applications of Artificial Intelligence, Volume 96, November 2020, 104010 (中科院SCI二区)

5Jingli Wu,Yong Wu. Practical Algorithms for allocating the roadside infrastructure in VANETs,  IET Intelligent Transport Systems, 2020,14(2): 103-109(SCI)

6Jingli Wu, Ke Pan, Kai Zhu, Qirong Cai. Identifying Common Driver Pathways based on Pan-cancer Data.Proceedings of 2019 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2019), San Diego, California, USA, November 18-21 , 2019, pp. 542--547. (CCF B 类会议,EI)

7Jingli Wu, Qirong Cai, Jinyan Wang, Yuanxiu Liao.Identifying mutated driver pathways in cancer by integrating multi-omics data, the 17th Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC 2019), Computational Biology and Chemistry, 2019, 80: 159-167 (CCF C类会议, SCI+EI)

8Jingli Wu,Qian Zhang. A Fast and Accurate Enumeration-based Algorithm for Haplotyping a Triploid Individual, Algorithms for Molecular Biology, 2018,13(1):10 (SCI)

9Jingli Wu,Yong Wu. A parthenogenetic algorithm for Deploying the Roadside Units in Vehicle Networks,In: Liu W., Giunchiglia F., Yang B. (eds) Proceedings of Knowledge Science, Engineering and Management, 2018. (CCF C类会议,EI)

10张倩,吴璟莉,基于枚举策略的三倍体个体单体型重建算法,计算机科学, 2017,44(1):75-79, 112

11Jingli Wu, Xixi Chen and Xianchen Li. Haplotyping a single triploid individual based on genetic algorithm. Bio-Medical Materials and Engineering, 2014, 24(6): 3753–3762. (SCI)

12Jingli Wu,Binbin Liang. A Fast and Accurate Algorithm for Individual Haplotype Reconstruction, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 11(4): 1350010, 2013. (SCI)

13JingliWu, Hua Wang,A Parthenogenetic Algorithm for the Founder Sequence Reconstruction Problem. Journal of Computers, 8(11): 2934-2941, 2013. (EI)

14JingliWu, Zhaocan Wang. Constructing the Minimum Founder Set from A Set of Recombinant SequencesJournal of Computers, 8(11): 2942-2950, 2013. (EI)

15JingliWuJian Xin WangJian’er Chen. A Heuristic Algorithm for Haplotype Reconstruction from Aligned Weighted SNP Fragments. International Journal of Bioinformatics Research and Applications, 2013,9(1): 13-24

16吴璟莉,王华,黄俊杰、梁彬彬创建者序列重建问题MFL模型的改进算法,小型微型计算机系统,2013, 34(4):860-863

17吴璟莉刘广海一种最小创建者集合的构建算法小型微型计算机系统, 33(6): 1316-1319, 2012

18JingliWu, Jianxin Wang and Jian’er Chen. A Parthenogenetic Algorithm for Single Individual SNP Haplotyping. Engineering Applications of Artificial Intelligence, 2009, 22(3):401-406 (SCI+EI)

19JingliWu, Jianxin Wang and Jian’er Chen. A Practical Algorithm Based on Particle Swarm Optimization for Haplotype Reconstruction. Applied Mathematics and Computation, 2009, 28(2): 363-372 (SCI)

20JingliWu, Jianxin Wang and Jian’er Chen. A Practical Algorithm for Multiplex PCR Primer Set Selection. International Journal of Bioinformatics Research and Applications, 2009,5(1): 38-49 (EI)